MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_3

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010487	TGATAT	2	12	66	77	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170650758
2	NC_010487	TTTCTT	2	12	88	99	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	170650758
3	NC_010487	A	7	7	103	109	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
4	NC_010487	TAT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
5	NC_010487	TTTG	2	8	123	130	0 %	75 %	25 %	0 %	170650758
6	NC_010487	ATC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650758
7	NC_010487	AAACAA	2	12	171	182	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170650758
8	NC_010487	AATA	2	8	183	190	75 %	25 %	0 %	0 %	170650758
9	NC_010487	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
10	NC_010487	CAAT	2	8	277	284	50 %	25 %	0 %	25 %	170650758
11	NC_010487	A	8	8	333	340	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
12	NC_010487	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
13	NC_010487	TGA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
14	NC_010487	AAC	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650758
15	NC_010487	TA	3	6	481	486	50 %	50 %	0 %	0 %	170650758
16	NC_010487	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
17	NC_010487	A	7	7	545	551	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
18	NC_010487	ATG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
19	NC_010487	ATA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650758
20	NC_010487	TTA	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
21	NC_010487	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650759
22	NC_010487	ACC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650759
23	NC_010487	GCAT	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	170650759
24	NC_010487	G	6	6	1927	1932	0 %	0 %	100 %	0 %	170650759
25	NC_010487	ATG	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
26	NC_010487	ATG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
27	NC_010487	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650759
28	NC_010487	T	7	7	2178	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	170650759
29	NC_010487	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650757
30	NC_010487	TAACG	2	10	2726	2735	40 %	20 %	20 %	20 %	170650757
31	NC_010487	CCG	2	6	2780	2785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650757
32	NC_010487	C	6	6	2808	2813	0 %	0 %	0 %	100 %	170650757

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.